MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus CN1

Total Repeats: 54796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022226	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459745
2	NC_022226	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459745
3	NC_022226	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459745
4	NC_022226	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459745
5	NC_022226	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
6	NC_022226	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459745
7	NC_022226	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459745
8	NC_022226	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459745
9	NC_022226	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	537459745
10	NC_022226	GCA	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459745
11	NC_022226	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459745
12	NC_022226	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	537459745
13	NC_022226	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459745
14	NC_022226	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459745
15	NC_022226	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459745
16	NC_022226	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459745
17	NC_022226	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459745
18	NC_022226	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
19	NC_022226	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537459745
20	NC_022226	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
21	NC_022226	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459745
22	NC_022226	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537459745
23	NC_022226	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
24	NC_022226	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
25	NC_022226	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537459745
26	NC_022226	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	537459745
27	NC_022226	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	537459745
28	NC_022226	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459745
29	NC_022226	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459745
30	NC_022226	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	537459745
31	NC_022226	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	537459745
32	NC_022226	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	537459745
33	NC_022226	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
34	NC_022226	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459745
35	NC_022226	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	537459745
36	NC_022226	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	537459745
37	NC_022226	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
38	NC_022226	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
39	NC_022226	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	537459746
40	NC_022226	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459746
41	NC_022226	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459746
42	NC_022226	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459746
43	NC_022226	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459746
44	NC_022226	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459746
45	NC_022226	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	537459746
46	NC_022226	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	537459746
47	NC_022226	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	537459746
48	NC_022226	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459746
49	NC_022226	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	537459746
50	NC_022226	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459746
51	NC_022226	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459746
52	NC_022226	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	537459746
53	NC_022226	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459746
54	NC_022226	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537459746
55	NC_022226	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	537459746
56	NC_022226	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459746
57	NC_022226	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459746
58	NC_022226	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	537459746
59	NC_022226	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459746
60	NC_022226	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459746
61	NC_022226	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459746
62	NC_022226	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459746
63	NC_022226	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459746
64	NC_022226	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537459746
65	NC_022226	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459746
66	NC_022226	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459746
67	NC_022226	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	537459746
68	NC_022226	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	537459746
69	NC_022226	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	537459746
70	NC_022226	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459746
71	NC_022226	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459746
72	NC_022226	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537459746
73	NC_022226	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459746
74	NC_022226	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	537459746
75	NC_022226	TAAAAA	2	12	3287	3298	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	537459746
76	NC_022226	ATT	2	6	3679	3684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459747
77	NC_022226	AAG	2	6	3692	3697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459747
78	NC_022226	GTA	2	6	3700	3705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459747
79	NC_022226	ATT	2	6	3748	3753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459747
80	NC_022226	TGG	2	6	3759	3764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459747
81	NC_022226	ATTA	2	8	3798	3805	50 %	50 %	0 %	0 %	537459747
82	NC_022226	TTCT	2	8	3888	3895	0 %	75 %	0 %	25 %	537459747
83	NC_022226	TCAT	2	8	3899	3906	25 %	50 %	0 %	25 %	537459747
84	NC_022226	ATG	2	6	3958	3963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459748
85	NC_022226	A	6	6	4182	4187	100 %	0 %	0 %	0 %	537459748
86	NC_022226	GTC	2	6	4222	4227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459748
87	NC_022226	AT	3	6	4235	4240	50 %	50 %	0 %	0 %	537459748
88	NC_022226	AGA	2	6	4271	4276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459748
89	NC_022226	CTC	2	6	4297	4302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537459748
90	NC_022226	GAC	2	6	4309	4314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459748
91	NC_022226	CTG	2	6	4345	4350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459748
92	NC_022226	AAT	2	6	4398	4403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459748
93	NC_022226	A	7	7	4429	4435	100 %	0 %	0 %	0 %	537459748
94	NC_022226	CAG	2	6	4464	4469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459748
95	NC_022226	AAG	2	6	4570	4575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459748
96	NC_022226	ATT	2	6	4588	4593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459748
97	NC_022226	GAA	2	6	4641	4646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459748
98	NC_022226	ATA	2	6	4666	4671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459748
99	NC_022226	GAT	2	6	4719	4724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459748
100	NC_022226	TTA	3	9	4854	4862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459748
101	NC_022226	GAT	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459748
102	NC_022226	TTA	2	6	4905	4910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459748
103	NC_022226	ACA	2	6	5065	5070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459749
104	NC_022226	GTAT	2	8	5137	5144	25 %	50 %	25 %	0 %	537459749
105	NC_022226	AG	4	8	5159	5166	50 %	0 %	50 %	0 %	537459749
106	NC_022226	ATA	2	6	5197	5202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459749
107	NC_022226	CAAAT	2	10	5230	5239	60 %	20 %	0 %	20 %	537459749
108	NC_022226	GTT	2	6	5244	5249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459749
109	NC_022226	A	6	6	5314	5319	100 %	0 %	0 %	0 %	537459749
110	NC_022226	TGG	2	6	5363	5368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459749
111	NC_022226	TGGCGG	2	12	5375	5386	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	537459749
112	NC_022226	TGG	2	6	5399	5404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459749
113	NC_022226	TCA	2	6	5421	5426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459749
114	NC_022226	TA	3	6	5480	5485	50 %	50 %	0 %	0 %	537459749
115	NC_022226	TCA	2	6	5486	5491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459749
116	NC_022226	A	6	6	5499	5504	100 %	0 %	0 %	0 %	537459749
117	NC_022226	AAG	2	6	5527	5532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459749
118	NC_022226	CAG	2	6	5625	5630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459749
119	NC_022226	AG	3	6	5637	5642	50 %	0 %	50 %	0 %	537459749
120	NC_022226	TGA	2	6	5690	5695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459749
121	NC_022226	AGA	2	6	5708	5713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459749
122	NC_022226	ATG	2	6	5782	5787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459749
123	NC_022226	TCA	2	6	5801	5806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459749
124	NC_022226	GAT	2	6	5814	5819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459749
125	NC_022226	GGT	2	6	5904	5909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459749
126	NC_022226	AGA	2	6	5984	5989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459749
127	NC_022226	TATC	2	8	6040	6047	25 %	50 %	0 %	25 %	537459749
128	NC_022226	ATT	2	6	6125	6130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459749
129	NC_022226	TAT	2	6	6197	6202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459749
130	NC_022226	GGC	2	6	6203	6208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537459749
131	NC_022226	TGC	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459749
132	NC_022226	A	6	6	6228	6233	100 %	0 %	0 %	0 %	537459749
133	NC_022226	CGT	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459749
134	NC_022226	GAA	2	6	6318	6323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459749
135	NC_022226	G	6	6	6357	6362	0 %	0 %	100 %	0 %	537459749
136	NC_022226	TAGA	2	8	6445	6452	50 %	25 %	25 %	0 %	537459749
137	NC_022226	TGGA	2	8	6571	6578	25 %	25 %	50 %	0 %	537459749
138	NC_022226	TTA	2	6	6597	6602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459749
139	NC_022226	TTC	2	6	6606	6611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537459749
140	NC_022226	TAT	2	6	6699	6704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459749
141	NC_022226	TGAAT	2	10	6740	6749	40 %	40 %	20 %	0 %	537459749
142	NC_022226	AATG	2	8	6794	6801	50 %	25 %	25 %	0 %	537459749
143	NC_022226	ACA	2	6	6819	6824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459749
144	NC_022226	TGT	2	6	6911	6916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459749
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147	NC_022226	TCAA	2	8	7025	7032	50 %	25 %	0 %	25 %	537459750
148	NC_022226	TCG	2	6	7148	7153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459750
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150	NC_022226	GTTATC	2	12	7303	7314	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	537459750
151	NC_022226	TTG	2	6	7318	7323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459750
152	NC_022226	ATGG	2	8	7347	7354	25 %	25 %	50 %	0 %	537459750
153	NC_022226	GCA	3	9	7362	7370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459750
154	NC_022226	TAA	2	6	7427	7432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459750
155	NC_022226	ATG	2	6	7459	7464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459750
156	NC_022226	AG	3	6	7473	7478	50 %	0 %	50 %	0 %	537459750
157	NC_022226	GGTA	2	8	7538	7545	25 %	25 %	50 %	0 %	537459750
158	NC_022226	CCA	2	6	7560	7565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537459750
159	NC_022226	TAAG	2	8	7603	7610	50 %	25 %	25 %	0 %	537459750
160	NC_022226	GGA	2	6	7640	7645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537459750
161	NC_022226	CTG	2	6	7669	7674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459750
162	NC_022226	TTCAA	2	10	7727	7736	40 %	40 %	0 %	20 %	537459750
163	NC_022226	GAA	2	6	7758	7763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459750
164	NC_022226	TTG	2	6	7786	7791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459750
165	NC_022226	A	6	6	7834	7839	100 %	0 %	0 %	0 %	537459750
166	NC_022226	TCGT	2	8	7849	7856	0 %	50 %	25 %	25 %	537459750
167	NC_022226	TGA	2	6	7889	7894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459750
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169	NC_022226	CAT	2	6	7996	8001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459750
170	NC_022226	TTA	2	6	8044	8049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459750
171	NC_022226	AAG	2	6	8056	8061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459750
172	NC_022226	ATT	2	6	8071	8076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459750
173	NC_022226	GTT	2	6	8094	8099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459750
174	NC_022226	AGA	2	6	8100	8105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459750
175	NC_022226	ATT	2	6	8190	8195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459750
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178	NC_022226	CAAGCT	2	12	8271	8282	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	537459750
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180	NC_022226	TTA	2	6	8352	8357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459750
181	NC_022226	TGA	2	6	8390	8395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459750
182	NC_022226	TTA	2	6	8403	8408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459750
183	NC_022226	AGTT	2	8	8410	8417	25 %	50 %	25 %	0 %	537459750
184	NC_022226	TGA	2	6	8453	8458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459750
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230	NC_022226	TTG	2	6	10403	10408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459751
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232	NC_022226	CCA	2	6	10495	10500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537459751
233	NC_022226	TAA	2	6	10503	10508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459751
234	NC_022226	TCT	2	6	10537	10542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537459751
235	NC_022226	AT	3	6	10902	10907	50 %	50 %	0 %	0 %	537459752
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237	NC_022226	ATT	2	6	10984	10989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459752
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239	NC_022226	A	7	7	11011	11017	100 %	0 %	0 %	0 %	537459752
240	NC_022226	TAT	2	6	11037	11042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459752
241	NC_022226	AAG	2	6	11183	11188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459752
242	NC_022226	ATG	2	6	11200	11205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459752
243	NC_022226	ATT	2	6	11223	11228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459752
244	NC_022226	ACAATT	2	12	11265	11276	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	537459752
245	NC_022226	T	6	6	11275	11280	0 %	100 %	0 %	0 %	537459752
246	NC_022226	TAT	2	6	11292	11297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459752
247	NC_022226	CT	3	6	11319	11324	0 %	50 %	0 %	50 %	537459752
248	NC_022226	TAGCAT	2	12	11360	11371	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	537459752
249	NC_022226	GAA	2	6	11404	11409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459752
250	NC_022226	AAG	2	6	11468	11473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459752
251	NC_022226	TA	3	6	11527	11532	50 %	50 %	0 %	0 %	537459752
252	NC_022226	AGA	2	6	11538	11543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459752
253	NC_022226	TGC	2	6	11568	11573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459752
254	NC_022226	ATG	2	6	11618	11623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459752
255	NC_022226	ACG	2	6	11701	11706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459752
256	NC_022226	CGTTG	2	10	11741	11750	0 %	40 %	40 %	20 %	537459752
257	NC_022226	AATG	2	8	11817	11824	50 %	25 %	25 %	0 %	537459752
258	NC_022226	GGT	2	6	11881	11886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459752
259	NC_022226	ATC	2	6	11921	11926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459752
260	NC_022226	CGT	2	6	11965	11970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459752
261	NC_022226	GAT	2	6	12051	12056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459752
262	NC_022226	TGC	3	9	12066	12074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459752
263	NC_022226	AAG	2	6	12146	12151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459752
264	NC_022226	GCT	2	6	12175	12180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459752
265	NC_022226	ATT	2	6	12196	12201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459752
266	NC_022226	GT	3	6	12215	12220	0 %	50 %	50 %	0 %	537459752
267	NC_022226	AGC	2	6	12249	12254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459752
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270	NC_022226	CAAT	2	8	12388	12395	50 %	25 %	0 %	25 %	537459752
271	NC_022226	ATT	2	6	12812	12817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459753
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283	NC_022226	TGA	2	6	13124	13129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459753
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390	NC_022226	AT	3	6	18973	18978	50 %	50 %	0 %	0 %	537459758
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